При помощи такого не хитрого скрипта вы можете рекурсивно удалить директорию или раздел вместе с файлами которые находятся в разделе
function removeDirectory($dir) { if ($objs = glob($dir . "/*")) { foreach ($objs as $obj) { is_dir($obj) ? removeDirectory($obj) : unlink($obj); } } rmdir($dir); }